RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366973.8

TATDN3-201, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-201ENST00000366973 ALS2Q96Q42 1657 aa18.08■□□□□ 0.49
TATDN3-201ENST00000366973 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
TATDN3-201ENST00000366973 RGPD5Q99666 1765 aa18.08■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.08■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.08■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 BECN1Q14457 450 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 PXDNQ92626 1479 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 NCAPD2Q15021 1401 aa18.07■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 TEFQ10587 303 aa18.06■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.06■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 CERKQ8TCT0 537 aa18.06■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 DCCP43146 1447 aa18.06■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.05■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 APBB1O00213 710 aa18.05■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 KCNQ3O43525 872 aa18.05■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 BTBD11A6QL63 1104 aa18.04■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 ERBB3P21860 1342 aa18.04■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.04■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 HMMRO75330 724 aa18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 GNAI2P04899 355 aa18.03■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.02■□□□□ 0.48
TATDN3-201ENST00000366973 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.02■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.01■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.01■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 GNAI3P08754 354 aa18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 NLRP2Q9NX02 1062 aa18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CHPF2Q9P2E5 772 aa18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 USP35Q9P2H5 1018 aa18■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 HOXB7P09629 217 aa17.99■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 NFKBIBQ15653 356 aa17.99■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 PXDNLA1KZ92 1463 aa17.98■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.98■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 TTC22Q5TAA0 569 aa17.98■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 ANXA1P04083 346 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CDC45O75419 566 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CHRNA2Q15822 529 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.97■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa17.96■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.96■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 USP44Q9H0E7 712 aa17.96■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TATDN3-201ENST00000366973 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.95■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 COL18A1P39060 1754 aa17.95■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 ATP8B2P98198 1209 aa17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa17.94■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 DNAAF4Q8WXU2 420 aa17.93■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 MEGF6O75095 1541 aa17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 BRINP3Q76B58 766 aa17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SDSP20132 328 aa17.91■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 HEG1Q9ULI3 1381 aa17.91■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 LRRCC1Q9C099 1032 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 ANTXR1Q9H6X2 564 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SPG7Q9UQ90 795 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 ADCY9O60503 1353 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 PHKG2P15735 406 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 PROSER3Q2NL68 480 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 BEND3Q5T5X7 828 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 HSCBQ8IWL3 235 aa17.9■□□□□ 0.46
TATDN3-201ENST00000366973 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.89■□□□□ 0.45
TATDN3-201ENST00000366973 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TATDN3-201ENST00000366973 PDE1AP54750 535 aa17.89■□□□□ 0.45
TATDN3-201ENST00000366973 SLC39A6Q13433 755 aa17.89■□□□□ 0.45
TATDN3-201ENST00000366973 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms