RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 SIK1P57059 783 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 MRC1P22897 1456 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 MTFR1LQ9H019 292 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 TJP1Q07157 1748 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 LGR6Q9HBX8 967 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 PTGER2P43116 358 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKAR2BP31323 418 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP6V1AP38606 617 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 ITPK1Q13572 414 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 RALBP1Q15311 655 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 MAP3K5Q99683 1374 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-201ENST00000366391 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 AK7Q96M32 723 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FCHSD2O94868 740 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 C4AP0C0L4 1744 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 MSH5O43196 834 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 IL17REQ8NFR9 667 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-201ENST00000366391 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 GNPATO15228 680 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PHF14O94880 888 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SSFA2P28290 1259 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC39A6Q13433 755 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 SMIM5Q71RC9 77 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 ARXQ96QS3 562 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 POLD1P28340 1107 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 TEFQ10587 303 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 MSL1Q68DK7 614 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP5-201ENST00000366391 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 NEFMP07197 916 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 SYT17Q9BSW7 474 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS6KA4O75676 772 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 CHD4Q14839 1912 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ADRA2BP18089 450 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF790Q6PG37 636 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 MCM10Q7L590 875 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP5-201ENST00000366391 DCTN1Q14203 1278 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 BTBD11A6QL63 1104 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 NFE2L2Q16236 605 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 KLHL34Q8N239 644 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 RFC4P35249 363 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNQ3O43525 872 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP5-201ENST00000366391 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 GYS1P13807 737 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP5-201ENST00000366391 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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