RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYPD8Q6UX82 237 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL27Q8NEV9 243 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADGRB3O60242 1522 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLIT1O75093 1534 aa11.14□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR20EP86478 221 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR20CP86479 221 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR20DP86480 221 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR20BP86481 221 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR20AP86496 221 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM32Q13049 653 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.13□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 MED14O60244 1454 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 GFRA3O60609 400 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM52Q96A61 297 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.12□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSC1Q92574 1164 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.11□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 LTKP29376 864 aa11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT7BP56706 349 aa11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNH2Q12809 1159 aa11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 IQGAP1P46940 1657 aa11.1□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRPM2O94759 1503 aa11.09□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.09□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.09□□□□□ -0.63
RNU1-38P-201ENST00000362817 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.08□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLTCL1P53675 1640 aa11.08□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDF9O60383 454 aa11.07□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.07□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFYVE9O95405 1425 aa11.07□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 WNT7AO00755 349 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTHP32929 405 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 EID1Q9Y6B2 187 aa11.06□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXC1Q12948 553 aa11.05□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.05□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIMS2Q9UQ26 1411 aa11.05□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.03□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.03□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF1BO60333 1816 aa11.02□□□□□ -0.64
RNU1-38P-201ENST00000362817 TNFRSF10AO00220 468 aa11.02□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6ZNB5 142 aa11.02□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP4X1Q8N118 509 aa11.01□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.01□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 CPS1P31327 1500 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFC5P40937 340 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP10Q9P2G4 905 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 AP1G2O75843 785 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 DGAT1O75907 488 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SKOR1P84550 965 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF511Q8NB15 262 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO41Q8TF61 875 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.99□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SH3BP2P78314 561 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 PKDCCQ504Y2 493 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 BAP1Q92560 729 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa10.98□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 NBPF14Q5TI25 921 aa10.97□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.97□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.97□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa10.97□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 DIP2AQ14689 1571 aa10.96□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 NWD1Q149M9 1564 aa10.96□□□□□ -0.65
RNU1-38P-201ENST00000362817 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms