RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
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SGMS1-201ENST00000361543 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.38□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa10.38□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa10.37□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.37□□□□□ -0.75
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SGMS1-201ENST00000361543 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.36□□□□□ -0.75
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF5Q96JK2 942 aa10.36□□□□□ -0.75
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SGMS1-201ENST00000361543 MRC1P22897 1456 aa10.35□□□□□ -0.75
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SGMS1-201ENST00000361543 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.34□□□□□ -0.75
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SGMS1-201ENST00000361543 SIK1P57059 783 aa10.33□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 ARXQ96QS3 562 aa10.33□□□□□ -0.76
SGMS1-201ENST00000361543 ATG3Q9NT62 314 aa10.33□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 CABP4P57796 275 aa10.32□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.32□□□□□ -0.76
SGMS1-201ENST00000361543 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 FLAD1Q8NFF5 587 aa10.31□□□□□ -0.76
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP53Q96M91 514 aa10.31□□□□□ -0.76
SGMS1-201ENST00000361543 CHD4Q14839 1912 aa10.31□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 PPP2R1AP30153 589 aa10.29□□□□□ -0.76
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP8Q14318 412 aa10.29□□□□□ -0.76
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SGMS1-201ENST00000361543 LGR6Q9HBX8 967 aa10.27□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.27□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.27□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.26□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.26□□□□□ -0.77
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SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.25□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.25□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 PRKAR2BP31323 418 aa10.25□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
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SGMS1-201ENST00000361543 TEFQ10587 303 aa10.23□□□□□ -0.77
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SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.22□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 RFC4P35249 363 aa10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 GPR162Q16538 588 aa10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 IL17REQ8NFR9 667 aa10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.21□□□□□ -0.77
SGMS1-201ENST00000361543 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.21□□□□□ -0.77
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