RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 NME9Q86XW9 330 aa22.06■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 FAM83GA6ND36 823 aa22.05■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.05■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.05■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 GNAI2P04899 355 aa22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.123e-6■■■■□ 22.4
KRCC1-201ENST00000347055 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 AGLP35573 1532 aa22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.03■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.03■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 GNAI3P08754 354 aa22.02■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.02■■□□□ 1.12
KRCC1-201ENST00000347055 RAPGEF3O95398 923 aa22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 MX1P20591 662 aa22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 FBLN1P23142 703 aa22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 CHMLP26374 656 aa22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 TPM3P06753 285 aa22.01■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 CACNA1FO60840 1977 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 DCTN1Q14203 1278 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 OVOS2Q6IE36 1432 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 LRRC37A3O60309 1634 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 SLC4A2P04920 1241 aa21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.99■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.98■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.98■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.98■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 HSPA4P34932 840 aa21.97■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 ATP8B2P98198 1209 aa21.97■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.97■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 RNF214Q8ND24 703 aa21.97■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 USP31Q70CQ4 1352 aa21.96■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.96■■□□□ 1.11
KRCC1-201ENST00000347055 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.95■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 UBE2HP62256 183 aa21.95■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 USP48Q86UV5 1035 aa21.95■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.95■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 APBB1O00213 710 aa21.94■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 PALD1Q9ULE6 856 aa21.94■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 PEAK1Q9H792 1746 aa21.94■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.93■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 KRT24Q2M2I5 525 aa21.93■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 RAB11FIP3O75154 756 aa21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 STK31Q9BXU1 1019 aa21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 KDRP35968 1356 aa21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.92■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 RAD50Q92878 1312 aa21.91■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 MCM10Q7L590 875 aa21.91■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.91■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 USP25Q9UHP3 1055 aa21.9■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.89■■□□□ 1.1
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 KDM4AO75164 1064 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 ADCY5O95622 1261 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.89■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 TTC14Q96N46 770 aa21.88■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.88■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.87■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 RILPL2Q969X0 211 aa21.87■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.87■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.87■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 KIF3AQ9Y496 699 aa21.87■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.86■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 USP6P35125 1406 aa21.86■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 G2E3Q7L622 706 aa21.86■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.86■■□□□ 1.09
KRCC1-201ENST00000347055 METP08581 1390 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms