RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 MEGF6O75095 1541 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 BACH2Q9BYV9 841 aa20.53■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 PHKG2P15735 406 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 PDE4AP27815 886 aa20.52■□□□□ 0.88
HPS1-202ENST00000338546 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 SMC5Q8IY18 1101 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 DCAF5Q96JK2 942 aa20.5■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 MRC1P22897 1456 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 FLIIQ13045 1269 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 GCC1Q96CN9 775 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 FAM161AQ3B820 660 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 G2E3Q7L622 706 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 RGS3P49796 1198 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-202ENST00000338546 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 CYP27B1O15528 508 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 EVA1CP58658 441 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 SKAP1Q86WV1 359 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 IL2RBP14784 551 aa20.43■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 KCNQ3O43525 872 aa20.42■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 NUCB1Q02818 461 aa20.41■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 ZNF790Q6PG37 636 aa20.41■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.41■□□□□ 0.86
HPS1-202ENST00000338546 GNAI3P08754 354 aa20.39■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 TOM1O60784 492 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 C8orf34Q49A92 452 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 F6X3S4 739 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 NECTIN2Q92692 538 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 HYPKQ9NX55 129 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 ATP10DQ9P241 1426 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 CABP4P57796 275 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 DCTPP1Q9H773 170 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 MEIS3Q99687 375 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 STRN4Q9NRL3 753 aa20.36■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 HMMRO75330 724 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 GNAI2P04899 355 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 CEP85Q6P2H3 762 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 BTG4Q9NY30 223 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 PHLPP1O60346 1717 aa20.35■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HPS1-202ENST00000338546 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.31■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 SLC39A6Q13433 755 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 KSR2Q6VAB6 950 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 DISP2A7MBM2 1401 aa20.3■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 ALDH1L1O75891 902 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 ERBB4Q15303 1308 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 BEND3Q5T5X7 828 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HPS1-202ENST00000338546 USP44Q9H0E7 712 aa20.29■□□□□ 0.84
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