RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.04■■□□□ 1.12
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PKP3-201ENST00000331563 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 KIF3AQ9Y496 699 aa22.04■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.03■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.03■■□□□ 1.12
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PKP3-201ENST00000331563 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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PKP3-201ENST00000331563 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.02■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB22O15209 634 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 USP26Q9BXU7 913 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 IL13P35225 146 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 SLIT1O75093 1534 aa22.01■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.01■■□□□ 1.11
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PKP3-201ENST00000331563 CFAP44Q96MT7 982 aa22■■□□□ 1.11
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PKP3-201ENST00000331563 FCHSD2O94868 740 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.98■■□□□ 1.11
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PKP3-201ENST00000331563 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 IGSF3O75054 1194 aa21.98■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.112e-8■■■□□ 18.2
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PKP3-201ENST00000331563 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 DCTN1Q14203 1278 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 USP25Q9UHP3 1055 aa21.97■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.96■■□□□ 1.11
PKP3-201ENST00000331563 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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PKP3-201ENST00000331563 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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PKP3-201ENST00000331563 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.92■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 ADCY5O95622 1261 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 NEK4P51957 841 aa21.91■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 REC8O95072 547 aa21.9■■□□□ 1.1
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PKP3-201ENST00000331563 NLRP6P59044 892 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 AKAP12Q02952 1782 aa21.9■■□□□ 1.1
PKP3-201ENST00000331563 NFE2L2Q16236 605 aa21.89■■□□□ 1.09
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PKP3-201ENST00000331563 TMX3Q96JJ7 454 aa21.88■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.88■■□□□ 1.09
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PKP3-201ENST00000331563 ABTB2Q8N961 1025 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 BRD1O95696 1058 aa21.85■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 KCNJ4P48050 445 aa21.84■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.84■■□□□ 1.09
PKP3-201ENST00000331563 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.84■■□□□ 1.09
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