RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 GNAI2P04899 355 aa20.19■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.19■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 AK9Q5TCS8 1911 aa20.19■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K5Q99683 1374 aa20.18■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.18■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC37A3O60309 1634 aa20.18■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.17■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.17■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 PDE1AP54750 535 aa20.17■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.17■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.16■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 FSD2A1L4K1 749 aa20.15■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 SSFA2P28290 1259 aa20.15■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 RABEP1Q15276 862 aa20.15■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SHQ1-201ENST00000325599 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.14■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 NBPF4Q96M43 638 aa20.14■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 LTN1O94822 1766 aa20.14■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 CASC1Q6TDU7 716 aa20.13■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 PANK2Q9BZ23 570 aa20.13■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 LGR6Q9HBX8 967 aa20.13■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.13■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 GNAI3P08754 354 aa20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 ATP8B2P98198 1209 aa20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 GBP4Q96PP9 640 aa20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 USP44Q9H0E7 712 aa20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 RRP9O43818 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 CACNA1FO60840 1977 aa20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 IP6K1Q92551 441 aa20.11■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.1■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 ERC2O15083 957 aa20.1■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 USP54Q70EL1 1684 aa20.1■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 KCNQ3O43525 872 aa20.09■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 PSME1Q06323 249 aa20.09■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 REC8O95072 547 aa20.09■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.08■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 MX1P20591 662 aa20.08■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.08■□□□□ 0.81
SHQ1-201ENST00000325599 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 PKP1Q13835 747 aa20.07■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.07■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.07■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ANXA1P04083 346 aa20.06■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.06■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 RILPL2Q969X0 211 aa20.06■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 NFAT5O94916 1531 aa20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.05■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ST18O60284 1047 aa20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ORAI2Q96SN7 254 aa20.04■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.03■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.03■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.03■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.02■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.02■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SHQ1-201ENST00000325599 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 CHMLP26374 656 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 SSH3Q8TE77 659 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PALD1Q9ULE6 856 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 MRE11P49959 708 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 NEK4P51957 841 aa20.01■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 PXDNLA1KZ92 1463 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 BTBD11A6QL63 1104 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 TEFQ10587 303 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 STAP2Q9UGK3 403 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 KCNH5Q8NCM2 988 aa20■□□□□ 0.79
SHQ1-201ENST00000325599 IL25Q9H293 177 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.8 ms