RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 CASC1Q6TDU7 716 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 SURF6O75683 361 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 TSHZ3Q63HK5 1081 aa16.09■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 GNAI3P08754 354 aa16.09■□□□□ 0.17
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HPS1-201ENST00000325103 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
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HPS1-201ENST00000325103 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.07■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 KIAA0232Q92628 1395 aa16.06■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 SRGAP3O43295 1099 aa16.06■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.05■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 ABCC4O15439 1325 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 SIL1Q9H173 461 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 ERBB3P21860 1342 aa16.03■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 ADAMTSL3P82987 1691 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HPS1-201ENST00000325103 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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HPS1-201ENST00000325103 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.02■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.02■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 ADGRB2O60241 1585 aa16■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 LRRCC1Q9C099 1032 aa16■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 MYD88Q99836 296 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 KDRP35968 1356 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 CRB1P82279 1406 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 RTL1A6NKG5 1358 aa15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 DCTPP1Q9H773 170 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 FAM177BA6PVY3 158 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 PHKG2P15735 406 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 KCNJ4P48050 445 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-201ENST00000325103 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.96■□□□□ 0.15
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HPS1-201ENST00000325103 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.96■□□□□ 0.14
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HPS1-201ENST00000325103 USP16Q9Y5T5 823 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 IL2RBP14784 551 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 HYPKQ9NX55 129 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 DCAF5Q96JK2 942 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 USP44Q9H0E7 712 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 AKAP12Q02952 1782 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-201ENST00000325103 CYP27B1O15528 508 aa15.92■□□□□ 0.14
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