RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.39□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM83GA6ND36 823 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 REC8O95072 547 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP7D2Q96T17 732 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 SYCE3A1L190 88 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CASC1Q6TDU7 716 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 ITSN1Q15811 1721 aa10.38□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 ERC2O15083 957 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 STRCQ7RTU9 1775 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 UQCRHLA0A096LP55 91 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 MBD3O95983 291 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 UQCRHP07919 91 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NWD1Q149M9 1564 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.37□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 TCHHQ07283 1943 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 BRD1O95696 1058 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CUL4AQ13619 759 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 KIAA0232Q92628 1395 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 DCTN1Q14203 1278 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 TMX3Q96JJ7 454 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 MEIS3Q99687 375 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 PTPRCP08575 1304 aa10.36□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 DYNC1I1O14576 645 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT24Q2M2I5 525 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NME9Q86XW9 330 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 IL17RAQ96F46 866 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM13BQ9NYF5 915 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.35□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 CHL1O00533 1208 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 PDE1AP54750 535 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NUTM2FA1L443 756 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 MCM2P49736 904 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 NEK4P51957 841 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.34□□□□□ -0.75
UBQLN3-201ENST00000311659 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 SSH2Q76I76 1423 aa10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PEAK1Q9H792 1746 aa10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 STRCP1A6NGW2 1772 aa10.33□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 APBB1O00213 710 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 RNF214Q8ND24 703 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 TSPY26PQ9H489 355 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PALD1Q9ULE6 856 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 CRB1P82279 1406 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ANAPC15P60006 121 aa10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 HMMRO75330 724 aa10.31□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 C14orf37Q86TY3 774 aa10.31□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.31□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.3□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 COG3Q96JB2 828 aa10.3□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNA1FO60840 1977 aa10.3□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.3□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC37A3O60309 1634 aa10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGEF10O15013 1369 aa10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 CHMLP26374 656 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 UVSSAQ2YD98 709 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 MCM10Q7L590 875 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 ACEP12821 1306 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 PHF14O94880 888 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC4A2P04920 1241 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10.28□□□□□ -0.76
UBQLN3-201ENST00000311659 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms