RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 IL13P35225 146 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ABCA6Q8N139 1617 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 CEP152O94986 1710 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 BECN2A8MW95 431 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO3Q9UK99 471 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 IQGAP1P46940 1657 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 F6X3S4 739 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 PIP4K2BP78356 416 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 TNRQ92752 1358 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ABCC3O15438 1527 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 MEIS3Q99687 375 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 RAB11FIP3O75154 756 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 APPP05067 770 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 SDSP20132 328 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 FLIIQ13045 1269 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRB3O60242 1522 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 SRGAP3O43295 1099 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 HIP1O00291 1037 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 TRDNQ13061 729 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 TSPY26PQ9H489 355 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 PSMA5P28066 241 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 CEP85Q6P2H3 762 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 RNF214Q8ND24 703 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 RUFY1Q96T51 708 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 H3BQV1 296 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 IFFO2Q5TF58 517 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 PAF1Q8N7H5 531 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ABCC4O15439 1325 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 AK7Q96M32 723 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 USP19O94966 1318 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 PDE1AP54750 535 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 STRN4Q9NRL3 753 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 PDCP20941 246 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 MAP7D2Q96T17 732 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 CHL1O00533 1208 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ATP7BP35670 1465 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 TRIM29Q14134 588 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 SIRT1Q96EB6 747 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 GLI2P10070 1586 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ERICH2A1L162 156 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 FSD1Q9BTV5 496 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 FLT4P35916 1363 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 PIK3R4Q99570 1358 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 KRT24Q2M2I5 525 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRG-201ENST00000295874 PANK2Q9BZ23 570 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms