RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.15■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP44Q96MT7 982 aa30.15■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 ACEP12821 1306 aa30.14■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 GPT2Q8TD30 523 aa30.13■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 NUCB2P80303 420 aa30.13■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 PKP1Q13835 747 aa30.13■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM94Q12767 1356 aa30.12■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 AATKQ6ZMQ8 1374 aa30.11■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 MYRIPQ8NFW9 859 aa30.11■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.11■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa30.1■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 LRSAM1Q6UWE0 723 aa30.1■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 C14orf37Q86TY3 774 aa30.09■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 TSC1Q92574 1164 aa30.07■■■□□ 2.41
PKDCC-201ENST00000294964 SYCE3A1L190 88 aa30.07■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF710Q8N1W2 664 aa30.07■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM63CQ9P1W3 806 aa30.07■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.06■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF428Q96B54 188 aa30.06■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ITSN1Q15811 1721 aa30.06■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.05■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 CBX1P83916 185 aa30.05■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.05■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC4O15439 1325 aa30.05■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 FOXO3O43524 673 aa30.04■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.04■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.04■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 RNF214Q8ND24 703 aa30.03■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.03■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP12Q02952 1782 aa30.02■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 APBB1O00213 710 aa30.01■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 RABEP1Q15276 862 aa30.01■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
PKDCC-201ENST00000294964 PTMAP06454 111 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 CHAMP1Q96JM3 812 aa30■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 C19orf44Q9H6X5 657 aa30■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.99■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 GCC1Q96CN9 775 aa29.98■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 CDC45O75419 566 aa29.98■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 ATP2B3Q16720 1220 aa29.98■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 ZDHHC9Q9Y397 364 aa29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 KIF20AO95235 890 aa29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 PRIMPOLQ96LW4 560 aa29.96■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.96■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
PKDCC-201ENST00000294964 DCCP43146 1447 aa29.95■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.384e-7■□□□□ 10.8
PKDCC-201ENST00000294964 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.93■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 FAM177BA6PVY3 158 aa29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 CHL1O00533 1208 aa29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 USP6P35125 1406 aa29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 MSH6P52701 1360 aa29.92■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 PEAK1Q9H792 1746 aa29.91■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.91■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 MST1RQ04912 1400 aa29.9■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
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PKDCC-201ENST00000294964 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.9■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.9■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 MPNDQ8N594 471 aa29.9■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A2P04920 1241 aa29.89■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
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PKDCC-201ENST00000294964 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.89■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.89■■■□□ 2.38
PKDCC-201ENST00000294964 F6X3S4 739 aa29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 ATF3P18847 181 aa29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 MEIS3Q99687 375 aa29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 G2E3Q7L622 706 aa29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.87■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 NECTIN2Q92692 538 aa29.87■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 TSPY26PQ9H489 355 aa29.87■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 ORAI2Q96SN7 254 aa29.86■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.86■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.86■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 USP26Q9BXU7 913 aa29.86■■■□□ 2.37
PKDCC-201ENST00000294964 KIF3AQ9Y496 699 aa29.86■■■□□ 2.37
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