RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 IFT57Q9NWB7 429 aa21.73■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 SLFN5Q08AF3 891 aa21.72■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.72■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 ITGB4P16144 1822 aa21.71■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 E9PSI1 815 aa21.7■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 CHL1O00533 1208 aa21.7■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 GNAI1P63096 354 aa21.7■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 KCNQ2O43526 872 aa21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 MBIPQ9NS73 344 aa21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 BTBD11A6QL63 1104 aa21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 PIGBQ92521 554 aa21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.68■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.68■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.68■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.68■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 SBF2Q86WG5 1849 aa21.67■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.67■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.67■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 NHSQ6T4R5 1651 aa21.67■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 KCNQ3O43525 872 aa21.66■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 SLC39A6Q13433 755 aa21.66■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.66■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 PAPPAQ13219 1627 aa21.66■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.66■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.64■■□□□ 1.06
ARPC5-201ENST00000294742 EP400Q96L91 3159 aa21.64■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF790Q6PG37 636 aa21.63■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 ATG3Q9NT62 314 aa21.62■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.62■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 KRT24Q2M2I5 525 aa21.61■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.6■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 BTAF1O14981 1849 aa21.6■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.6■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 TRIM37O94972 964 aa21.59■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.58■■□□□ 1.05
ARPC5-201ENST00000294742 TSPYL6Q8N831 410 aa21.58■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.58■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.57■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 PALLDQ8WX93 1383 aa21.55■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.55■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.53■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.53■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 C5P01031 1676 aa21.52■■□□□ 1.04
ARPC5-201ENST00000294742 VAMP4O75379 141 aa21.51■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 SIK1P57059 783 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 LY75O60449 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 HOXB7P09629 217 aa21.48■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 TJP1Q07157 1748 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 USP16Q9Y5T5 823 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 APBA3O96018 575 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 ATP6V1AP38606 617 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.46■■□□□ 1.03
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 KCNQ4P56696 695 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 ITPK1Q13572 414 aa21.45■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 PLSCR1O15162 318 aa21.44■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.44■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 NECTIN2Q92692 538 aa21.44■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 ILDR2Q71H61 639 aa21.44■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.43■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 PROM2Q8N271 834 aa21.42■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.42■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF428Q96B54 188 aa21.42■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.42■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.41■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.41■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ARPC5-201ENST00000294742 TXNRD1Q16881 649 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms