RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
NTN3-201ENST00000293973 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.57■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.56■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.56■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 KAT6BQ8WYB5 2073 aa32.55■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 CABP4P57796 275 aa32.54■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa32.54■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 KDM3BQ7LBC6 1761 aa32.54■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 BTBD11A6QL63 1104 aa32.53■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.52■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 ITGB4P16144 1822 aa32.51■■■□□ 2.8
NTN3-201ENST00000293973 RXRBP28702 533 aa32.49■■■□□ 2.79
NTN3-201ENST00000293973 BRWD3Q6RI45 1802 aa32.47■■■□□ 2.79
NTN3-201ENST00000293973 POTEAQ6S8J7 498 aa32.46■■■□□ 2.79
NTN3-201ENST00000293973 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.46■■■□□ 2.79
NTN3-201ENST00000293973 RCAN3Q9UKA8 241 aa32.45■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 C8orf58Q8NAV2 365 aa32.44■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 KCNQ3O43525 872 aa32.43■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 SLC39A6Q13433 755 aa32.43■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 KRT24Q2M2I5 525 aa32.43■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 ZNF790Q6PG37 636 aa32.43■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 TSPYL6Q8N831 410 aa32.43■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 BCL9O00512 1426 aa32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 PIGBQ92521 554 aa32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 PAPPAQ13219 1627 aa32.41■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.4■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 FAM182BQ5T319 152 aa32.39■■■□□ 2.78
NTN3-201ENST00000293973 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.38■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 TTC5Q8N0Z6 440 aa32.38■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 RGS12O14924 1447 aa32.37■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 VAMP4O75379 141 aa32.37■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 UBR2Q8IWV8 1755 aa32.36■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 EP400Q96L91 3159 aa32.35■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 SBF2Q86WG5 1849 aa32.34■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 ZNF428Q96B54 188 aa32.34■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 HEG1Q9ULI3 1381 aa32.33■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 RARSP54136 660 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 NHSQ6T4R5 1651 aa32.32■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.32■■■□□ 2.77
NTN3-201ENST00000293973 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 KCNQ2O43526 872 aa32.32■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 ATG3Q9NT62 314 aa32.31■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 KCPQ6ZWJ8 1503 aa32.31■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 FMNL2Q96PY5 1086 aa32.3■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 HOXB7P09629 217 aa32.29■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 FAM196AQ6ZSG2 479 aa32.28■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 BCAR3O75815 825 aa32.27■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.27■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 BCL2L13Q9BXK5 485 aa32.27■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 C5P01031 1676 aa32.27■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 ALDH1L2Q3SY69 923 aa32.27■■■□□ 2.76
NTN3-201ENST00000293973 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 SMC4Q9NTJ3 1288 aa32.25■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 BTAF1O14981 1849 aa32.25■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 RNF123Q5XPI4 1314 aa32.23■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa32.23■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa32.23■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 PTF1AQ7RTS3 328 aa32.23■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.21■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 LAMB4A4D0S4 1761 aa32.21■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 RRP1P56182 461 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 NECTIN2Q92692 538 aa32.2■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.2■■■□□ 2.75
NTN3-201ENST00000293973 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 CACNA1FO60840 1977 aa32.19■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 PALLDQ8WX93 1383 aa32.18■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 VSIG10Q8N0Z9 540 aa32.17■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 STK31Q9BXU1 1019 aa32.17■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 USP16Q9Y5T5 823 aa32.15■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 PLIN1O60240 522 aa32.14■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 KIF16BQ96L93 1317 aa32.14■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 SLC4A9Q96Q91 983 aa32.14■■■□□ 2.74
NTN3-201ENST00000293973 TRIM37O94972 964 aa32.13■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 SLC4A2P04920 1241 aa32.13■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.12■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 SIK1P57059 783 aa32.12■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 CHPF2Q9P2E5 772 aa32.12■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 CANXP27824 592 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
NTN3-201ENST00000293973 TJP1Q07157 1748 aa32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms