RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 BTBD11A6QL63 1104 aa15.63■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 VAMP4O75379 141 aa15.63■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.63■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 HOXB7P09629 217 aa15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 CABP4P57796 275 aa15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 MIS18AQ9NYP9 233 aa15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.61■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.6■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 NEFLP07196 543 aa15.59■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF790Q6PG37 636 aa15.59■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 TSPYL6Q8N831 410 aa15.59■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.59■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 BCL9O00512 1426 aa15.59■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 PAPPAQ13219 1627 aa15.58■□□□□ 0.09
ZNF3-201ENST00000292393 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 SSH1Q8WYL5 1049 aa15.57■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 KIF16BQ96L93 1317 aa15.57■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 BCAR3O75815 825 aa15.56■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.56■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.56■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 KRT24Q2M2I5 525 aa15.55■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.55■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.55■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 KCNQ3O43525 872 aa15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.54■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 PDE3AQ14432 1141 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 PIGBQ92521 554 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.53■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 MS4A1P11836 297 aa15.52■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 SLC39A6Q13433 755 aa15.52■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.52■□□□□ 0.08
ZNF3-201ENST00000292393 A0A0G2JS52 829 aa15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 MYT1Q01538 1121 aa15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.51■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ITGB4P16144 1822 aa15.5■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.5■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 STK31Q9BXU1 1019 aa15.5■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 PTPRCP08575 1304 aa15.49■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 PLIN1O60240 522 aa15.49■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 FKBP8Q14318 412 aa15.49■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.49■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ERBB4Q15303 1308 aa15.48■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ATG3Q9NT62 314 aa15.48■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 NHSQ6T4R5 1651 aa15.48■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 SLC4A2P04920 1241 aa15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 RXRBP28702 533 aa15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.47■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 TRIM27P14373 513 aa15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 C5P01031 1676 aa15.46■□□□□ 0.07
ZNF3-201ENST00000292393 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.45■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.45■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.45■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 AAMPQ13685 434 aa15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 FAM196AQ6ZSG2 479 aa15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 HYPKQ9NX55 129 aa15.44■□□□□ 0.06
ZNF3-201ENST00000292393 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms