RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ZNF827Q17R98 1081 aa29.63■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 AKT1S1Q96B36 256 aa29.63■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.63■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa29.62■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.62■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa29.61■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 SIK1P57059 783 aa29.61■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.61■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.6■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 STK32BQ9NY57 414 aa29.59■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.59■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
SYF2-201ENST00000236273 ITPK1Q13572 414 aa29.57■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 NFE2L2Q16236 605 aa29.57■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 DCTN1Q14203 1278 aa29.56■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.323e-6■■■■□ 20.8
SYF2-201ENST00000236273 MCM10Q7L590 875 aa29.56■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 C5P01031 1676 aa29.56■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A6Q13433 755 aa29.55■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.54■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1AP38606 617 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 CASZ1Q86V15 1759 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 NEFMP07197 916 aa29.52■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.52■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa29.52■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 TEFQ10587 303 aa29.51■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 RUNDC1Q96C34 613 aa29.51■■■□□ 2.32
SYF2-201ENST00000236273 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 C4BP0C0L5 1744 aa29.5■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 KCPQ6ZWJ8 1503 aa29.49■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 QSER1Q2KHR3 1735 aa29.49■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 AMIGO3Q86WK7 504 aa29.48■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa29.48■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 UBR2Q8IWV8 1755 aa29.47■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 RIPK4P57078 832 aa29.46■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 MRS2Q9HD23 443 aa29.46■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.46■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 KCNQ3O43525 872 aa29.45■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 ZNF790Q6PG37 636 aa29.45■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SYF2-201ENST00000236273 TJP1Q07157 1748 aa29.45■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 BTBD11A6QL63 1104 aa29.43■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 SMIM5Q71RC9 77 aa29.43■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.43■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.42■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC10Q8IXB1 793 aa29.41■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.4■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB7AO95365 584 aa29.39■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 NEUROD2Q15784 382 aa29.39■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 AK7Q96M32 723 aa29.39■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.39■■■□□ 2.3
SYF2-201ENST00000236273 LRP5O75197 1615 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 APAF1O14727 1248 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 HEG1Q9ULI3 1381 aa29.36■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 GNPATO15228 680 aa29.35■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 CRKLP46109 303 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 PTGER2P43116 358 aa29.34■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.34■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 MTFR1LQ9H019 292 aa29.34■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 SPON1Q9HCB6 807 aa29.34■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 SSFA2P28290 1259 aa29.33■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.33■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.33■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 FMNL2Q96PY5 1086 aa29.33■■■□□ 2.29
SYF2-201ENST00000236273 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.32■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KA4O75676 772 aa29.32■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.32■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 PHF14O94880 888 aa29.31■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 COL24A1Q17RW2 1714 aa29.31■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa29.29■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.28■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 USP16Q9Y5T5 823 aa29.27■■■□□ 2.28
SYF2-201ENST00000236273 MSH5O43196 834 aa29.26■■■□□ 2.27
SYF2-201ENST00000236273 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms