RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 INPP5BP32019 993 aa15.02□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC69A6NI79 296 aa15.02□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.02□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.02□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 RAD50Q92878 1312 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 HSPA4P34932 840 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 GNG11P61952 73 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.01□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ATP8B1O43520 1251 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 MAGEA9P43362 315 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 FBLN2P98095 1184 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 FILIP1LQ4L180 1135 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 EVCP57679 992 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TYRO3Q06418 890 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CFAP100Q494V2 611 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CEP120Q8N960 986 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 PRXQ9BXM0 1461 aa15□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ANKRD1Q15327 319 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 E2F4Q16254 413 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CNTROBQ8N137 903 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SATB1Q01826 763 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 GNAI1P63096 354 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ELP1O95163 1332 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ERBINQ96RT1 1412 aa14.99□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ACTN2P35609 894 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 GPT2Q8TD30 523 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 INSRP06213 1382 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TUBBP07437 444 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ME1P48163 572 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 VEZTQ9HBM0 779 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.98□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 GCKP35557 465 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 RAI14Q9P0K7 980 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SUFUQ9UMX1 484 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 TRDNQ13061 729 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ODF2Q5BJF6 829 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 ANKRD7Q92527 254 aa14.97□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 NUTM1Q86Y26 1132 aa14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 FOSBP53539 338 aa14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SCLT1Q96NL6 688 aa14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 DACH1Q9UI36 760 aa14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 USP19O94966 1318 aa14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
VAMP4-201ENST00000236192 SOX12O15370 315 aa14.96□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF75DP51815 510 aa14.96□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.96□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 STK38Q15208 465 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SRGAP3O43295 1099 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 SYNJ1O43426 1573 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 PHACTR2O75167 634 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 EXOC4Q96A65 974 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF428Q96B54 188 aa14.95□□□□□ -0.02
VAMP4-201ENST00000236192 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms