RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233121.6

MAPRE3-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE3, Length 1,892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3-201ENST00000233121 HMMRO75330 724 aa22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 ATF3P18847 181 aa22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 F6X3S4 739 aa22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 TMEM94Q12767 1356 aa22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 HOXB7P09629 217 aa22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 RGPD5Q99666 1765 aa22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 GNAI2P04899 355 aa22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 GNAI3P08754 354 aa22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 TEFQ10587 303 aa22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 LGR6Q9HBX8 967 aa22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 NECTIN2Q92692 538 aa22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHG5O94827 1062 aa22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 NFKBIBQ15653 356 aa22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 PXDNQ92626 1479 aa22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 CDC45O75419 566 aa22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.72■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 BTBD11A6QL63 1104 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 TTC22Q5TAA0 569 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 ERBB3P21860 1342 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.71■■□□□ 1.23
MAPRE3-201ENST00000233121 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.7■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.69■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 ABCC6O95255 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.67■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 COL18A1P39060 1754 aa22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 ATP8B2P98198 1209 aa22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 KCNQ3O43525 872 aa22.65■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 APBB1O00213 710 aa22.64■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 HSCBQ8IWL3 235 aa22.64■■□□□ 1.22
MAPRE3-201ENST00000233121 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.64■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 USP44Q9H0E7 712 aa22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.63■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SNX21Q969T3 373 aa22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 CASC1Q6TDU7 716 aa22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.62■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 BCL11AQ9H165 835 aa22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.6■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SPG7Q9UQ90 795 aa22.59■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
MAPRE3-201ENST00000233121 SDSP20132 328 aa22.58■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 PDE1AP54750 535 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 BEND3Q5T5X7 828 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 CPDO75976 1380 aa22.57■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 SSH3Q8TE77 659 aa22.56■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 ADCY9O60503 1353 aa22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 KIF2CQ99661 725 aa22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 MEGF6O75095 1541 aa22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.55■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.54■■□□□ 1.2
MAPRE3-201ENST00000233121 HYPKQ9NX55 129 aa22.54■■□□□ 1.2
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