RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RHBDD2-201ENST00000006777 RGS12O14924 1447 aa27.14■■□□□ 1.94
RHBDD2-201ENST00000006777 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.13■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 PHKG2P15735 406 aa27.12■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.12■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.11■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.09■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RHBDD2-201ENST00000006777 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.07■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 SKAP1Q86WV1 359 aa27.07■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 DCAF5Q96JK2 942 aa27.06■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 EVA1CP58658 441 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 G2E3Q7L622 706 aa27.05■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 FLIIQ13045 1269 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 MRC1P22897 1456 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP27B1O15528 508 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 KCNQ3O43525 872 aa27.04■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.03■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 RGS3P49796 1198 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 STRN4Q9NRL3 753 aa27.02■■□□□ 1.92
RHBDD2-201ENST00000006777 PHLPP1O60346 1717 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 IL2RBP14784 551 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 PDE4AP27815 886 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 NECTIN2Q92692 538 aa27.01■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 SMC5Q8IY18 1101 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 TOM1O60784 492 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 BACH2Q9BYV9 841 aa27■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.98■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF790Q6PG37 636 aa26.97■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 BTG4Q9NY30 223 aa26.97■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.96■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.95■■□□□ 1.91
RHBDD2-201ENST00000006777 F6X3S4 739 aa26.95■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.95■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.94■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 GCC1Q96CN9 775 aa26.93■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.92■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 CABP4P57796 275 aa26.92■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM161AQ3B820 660 aa26.92■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.9■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.9■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.9■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 MEIS3Q99687 375 aa26.9■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP10DQ9P241 1426 aa26.89■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC39A6Q13433 755 aa26.89■■□□□ 1.9
RHBDD2-201ENST00000006777 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.88■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 NUCB1Q02818 461 aa26.88■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.87■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 HYPKQ9NX55 129 aa26.87■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 C5P01031 1676 aa26.87■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 GNAI3P08754 354 aa26.86■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 PIP4K2BP78356 416 aa26.86■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.86■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 C8orf34Q49A92 452 aa26.85■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 CEP85Q6P2H3 762 aa26.85■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 DISP2A7MBM2 1401 aa26.85■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 USP35Q9P2H5 1018 aa26.84■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 GNAI2P04899 355 aa26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.83■■□□□ 1.89
RHBDD2-201ENST00000006777 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 DCTPP1Q9H773 170 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 HMMRO75330 724 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.81■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 PAPPAQ13219 1627 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 ADCY9O60503 1353 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 ANXA1P04083 346 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.8■■□□□ 1.88
RHBDD2-201ENST00000006777 NRAPQ86VF7 1730 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 193.2 ms