RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027878.13

Prrx1-201, Transcript of Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrx1, Length 4,952 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Eddm13E9Q7F5 164 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ncoa4Q5U4H9 625 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Me1P06801 572 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tnni2P13412 182 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ubxn2bQ0KL01 331 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tmem143Q8VD26 458 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Naa16Q9DBB4 864 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Slc27a3O88561 667 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 GpkowQ56A08 488 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Usp33Q8R5K2 909 aa13.17□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pard3Q99NH2 1333 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Usp19Q3UJD6 1360 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dnajc5gQ8C632 165 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Slc12a5Q91V14 1138 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Odf2lQ9D478 642 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ca8P28651 291 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Taf7Q9R1C0 341 aa13.16□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Adamts12Q811B3 1600 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Irx3P81067 507 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Mum1Q6DID5 682 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 CltaO08585 235 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Prkg1P0C605 671 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 NyxP83503 476 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gnat3Q3V3I2 354 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Sos1Q62245 1319 aa13.15□□□□□ -0.3
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Q8C6G1 249 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 VgfQ0VGU4 617 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Xrcc4Q924T3 326 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Phkg2Q9DB30 406 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Large2Q5XPT3 690 aa13.14□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Stox1B2RQL2 990 aa13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fmn2Q9JL04 1578 aa13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Asxl1P59598 1514 aa13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa13.13□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Atp1b3P97370 278 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Vmn1r199Q8R280 367 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trim29Q8R2Q0 587 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Arhgap33Q80YF9 1305 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc129Q14B48 1034 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Robo2Q7TPD3 1470 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Apba2P98084 750 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dok7Q18PE0 504 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Trpc5Q9QX29 975 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Znf335A2A5K6 1337 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Tpd52l1O54818 204 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Chpf2Q3UU43 768 aa13.12□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Uggt2E9Q4X2 1504 aa13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gm12185Q5NCB2 835 aa13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 IntuQ059U7 942 aa13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Llgl2Q3TJ91 1027 aa13.11□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Dcaf5Q80T85 946 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cplx1P63040 134 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 RgmbQ7TQ33 436 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccdc30Q8BVF4 654 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Letm1Q9Z2I0 738 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Plch2A2AP18 1501 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pde4aO89084 844 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ciapin1Q8WTY4 309 aa13.1□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Eya1P97767 591 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Anp32aO35381 247 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Yy1Q00899 414 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 ParnQ8VDG3 624 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 GckrQ91X44 587 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Casc1Q6TDU8 730 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Rhot2Q8JZN7 620 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Frat2Q8K025 231 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam213aQ9CYH2 218 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Nup133Q8R0G9 1155 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ccer1Q9CQL2 403 aa13.09□□□□□ -0.31
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Pet2A2AHY8 747 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Eif4a2P10630 407 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Fam83gQ5SWY7 812 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Galntl5Q9D4M9 431 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 CgnP59242 1191 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Cwc27Q3TKY6 469 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 Map3k19E9Q3S4 1311 aa13.08□□□□□ -0.32
Prrx1-201ENSMUST00000027878 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.7 ms