Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DCAF1Q9Y4B6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
DCAF1Q9Y4B6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms