Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms