Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNL1Q9UK58 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNL1Q9UK58 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms