Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FOXD3Q9UJU5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms