Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MLH3Q9UHC1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MLH3Q9UHC1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms