Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KDM5BQ9UGL1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KDM5BQ9UGL1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms