Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRP2BPQ9P2M1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms