Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HCN3Q9P1Z3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HCN3Q9P1Z3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms