Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFDN4Q9NQP4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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