Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms