Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms