Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF541Q9H0D2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF541Q9H0D2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms