Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLIRPQ9GZT3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms