Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TIMD4Q96H15 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TIMD4Q96H15 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms