Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C7orf43Q8WVR3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C7orf43Q8WVR3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms