Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps6ka5Q8C050 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms