Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME9Q86XW9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME9Q86XW9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms