Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD109Q6YHK3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD109Q6YHK3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms