Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL24A1Q17RW2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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