Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB35Q15286 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB35Q15286 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB35Q15286 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB35Q15286 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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RAB35Q15286 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB35Q15286 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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