Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX3Q13761 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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