Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN3Q13286 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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