Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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