Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
DSC1Q08554 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DSC1Q08554 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms