Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COL16A1Q07092 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms