Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1T1Q06455 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1T1Q06455 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms