Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN7AQ01118 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms