Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITPNAQ00169 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms