Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CABP4P57796 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABP4P57796 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms