Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APOBEC3AP31941 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3AP31941 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms